Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
OptnQ8K3K8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OptnQ8K3K8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms