Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms