Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssh3Q8K330 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms