Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim68Q8K243 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Trim68Q8K243 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim68Q8K243 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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