Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sde2Q8K1J5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms