Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FgbQ8K0E8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FgbQ8K0E8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FgbQ8K0E8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FgbQ8K0E8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FgbQ8K0E8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FgbQ8K0E8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FgbQ8K0E8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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FgbQ8K0E8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FgbQ8K0E8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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