Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms