Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clip4Q8CI96 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clip4Q8CI96 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clip4Q8CI96 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clip4Q8CI96 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Clip4Q8CI96 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip4Q8CI96 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Clip4Q8CI96 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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