Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Phc3Q8CHP6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Phc3Q8CHP6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Phc3Q8CHP6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Phc3Q8CHP6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Phc3Q8CHP6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phc3Q8CHP6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms