Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms