Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Lrrc9Q8CDN9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Lrrc9Q8CDN9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Lrrc9Q8CDN9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc9Q8CDN9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Lrrc9Q8CDN9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Lrrc9Q8CDN9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Lrrc9Q8CDN9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms