Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccdc38Q8CDN8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccdc38Q8CDN8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms