Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Bcas3Q8CCN5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bcas3Q8CCN5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Bcas3Q8CCN5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Bcas3Q8CCN5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Bcas3Q8CCN5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas3Q8CCN5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms