Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms