Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hdac7Q8C2B3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac7Q8C2B3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hdac7Q8C2B3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hdac7Q8C2B3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hdac7Q8C2B3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hdac7Q8C2B3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hdac7Q8C2B3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hdac7Q8C2B3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac7Q8C2B3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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