Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms