Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms