Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms