Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik4Q8BMF5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms