Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c2Q8BL74 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms