Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gpc2Q8BKV1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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