Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms