Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms