Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn3Q8BHH8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Clrn3Q8BHH8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Clrn3Q8BHH8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Clrn3Q8BHH8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clrn3Q8BHH8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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