Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atg4dQ8BGV9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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