Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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