Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Liat1Q810M6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms