Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cracr2bQ80ZJ8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cracr2bQ80ZJ8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms