Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp8Q80U87 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp8Q80U87 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms