Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NischQ80TM9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms