Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lamp3Q7TST5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lamp3Q7TST5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms