Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms