Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Actn1Q7TPR4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Actn1Q7TPR4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Actn1Q7TPR4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Actn1Q7TPR4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Actn1Q7TPR4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Actn1Q7TPR4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Actn1Q7TPR4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Actn1Q7TPR4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms