Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp397Q7TNK4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms