Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sbno2Q7TNB8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms