Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms