Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme8Q715T0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms