Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms