Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Topbp1Q6ZQF0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms