Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms