Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrimpolQ6P1E7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrimpolQ6P1E7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms