Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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NipblQ6KCD5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NipblQ6KCD5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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