Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ParpbpQ6IRT3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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