Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Krt40Q6IFX3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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