Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms