Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca2Q6DIC0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca2Q6DIC0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms