Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms