Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Fndc3c1Q6DFV6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc3c1Q6DFV6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc3c1Q6DFV6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc3c1Q6DFV6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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