Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rftn1Q6A0D4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms