Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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